音讯了解从测序的下机数据（raw data）入手下手。原始…下机数据（■raw data）中会包括接！ 头源自○文◁库ad□a p…ter）序列、测序质地很低的碱基、未测★出…◁的碱○■▽基（以 N□ 示意=），这会对后续的信！ 息了解形成很大的滋扰，以是，最先必要对原始下机数 据（raw ■ ○data）实 行□□△过滤获得 c★ ★□l e□an？ 质地及格的基因组 DNA 样 品通过超声波高职能样品★经管=编制（Covaris）随机打断成 主峰是 200bp-=300bp 控制的片 断。随后实△行 DNA □ 片 断终□局修复，3’端加上“A”碱基，两头 加上文库接头。接头贯□ 串后 ○的文 库 …实 ◁行★○线■ 性扩 增□ （LM-△ P CR ）制■ 备◁成杂□交文▽ 库。取适量的 杂交文库与外显子芯片实行拘捕富集 全外显子测序了解流程，洗脱掉未富集的=片断○后实 行扩增。扩增产品经○ Agilent 2100 bioanal yze○r 仪器（Agilent DNA 1000 R○eag○ents）和 QPCR 质控，质控及格后即 可上机测序< st★rong>▽ 全外显子测序了解流程。咱们行使 Illu mi na H◁iSe q □系列=平▽台，对每个及格的文库实…行高通■量测序尊龙凯时，并保 证每…个样品 的 数 据量达标全外显子测序分析尊龙凯时流程。测序获得的原始图像数据，尊龙凯时人生就博经 Illum○ina○ 碱基识别软件（Base Calling）转化 为原始序列数据（raw★ r eads），即双终局 reads（ pai ○red-end reads）尊龙凯时，数据 以 F ASTQ =▽○ □文献款式存储，称之为 ra w da t…a。 每个样品的测序深度、笼盖度、比对○ 率 ▽▽□等 □ 评=判★目标实 行统计。尊龙凯时人生就博 为了担保高质地的测！ 识别变异否显现正在dbsnp库v141中或者确定其正在千人基因组项目中的次等位基因频率=maf是否低于1或者确定编码区非同义突变的snps的sift值是否小于005或者变异的顽固性预测值ge rp值是否大于2或其它说明音讯等！ 到 BAM○ 款式的最初△的比对□结 果文献。为了确保变异检测=的精准性，咱们服从 G A▽ …TK 官方？
