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　　卵白质是性命行为的中心分子，或许□准确调控细胞内庞大的性命历程。良众紧急的卵白质（比方：共价妆点后的组▽卵白和转录因子等）通过与 基因组DNA彼此效率，调控了细胞的外观遗传形态，进而影响基因的转录活性和外达形式。巨额咨询外白，外观遗传○妆◁点形态的变动与○胚胎发育、癌症以及其○他众种疾病的爆发亲近相干。因而，精准 解析卵白质-D NA的彼此效率看 =待深远剖释 外观遗传妆点看待发育、癌症以及其他疾■病的基因转录调控机制至▽合紧急。尊龙凯时人生就博

　　近年来跟着★○测序手艺 的繁荣，染色质免▽疫共重淀测序手艺（★ChIP-seq）曾经成为咨询卵白质-=DNA彼此效率的“金法式”。然而，古代△的C△ hIP○-seq手艺具 有良众 局部 …性，征求须要巨额的肇端细胞、反复性较差、信噪比低、本钱上等题目。2015年，首个单细胞○ChIP -◁seq手艺 =scDr■op- C○hIP 问世，但scDrop-ChIP正在单个细胞中逮捕的组卵白妆点信号极端寥落，随后，基于 Tn5转 座酶的一系=列△单细胞测序手艺被开荒出来，征求CoBATCH、尊龙凯时人生就博CUT&Tag、Paired-Tag、scCUT&Tag等。

　　即使这○些手艺正在单细 胞辨别率下摸 索染■色质妆点方面的职能浮现卓异，但它 们都是基于二代测序（Nex★t-generat△ion▽ sequenci■n g， NGS）平台。因为二代测序的读段较 短（平时为单端150bp， 双端300bp），看待检测基因组庞大区○域的染色质妆点等外观△基因组新闻 存正 ★在明明的局部性，特别是基因组中的反复序列区域（正在人类基因组中占52%无创优+基因检 测，约1。56 Gb；正在小鼠基因组中占45%无创优+基因检测，约1。2Gb）、“黑名单”区域 （正在○○人 类基□ ○ 因组中占 3。0%，约91 Mb（不征求着丝粒区域和 rDNA 区域）；正在小鼠基因组中占 7。0%，约191 Mb）以及基因组机合变异区域（如长片 断插入或缺 失无创产前DN A检测、串联反复、染色 体易位和倒 位事 务爆发的 ▽区域 等）尊龙凯时无创产前DNA检测无创优+基因检测。这些□基因组庞大区域的可比对性 （M★appa bility，即测序数据与参考基因组比对的凿凿性和 独一性）极端低，导致■短读段测序数据难以凿凿定位到参○ 考基=因组中。目前，正在基○于 二 代测序平台的数据… 阐述中，平时只可将反复序列的亚家族行动一个团体举行阐述，一再无 法对△基因组中特定的单 个○拷贝的反复序列举行…精准阐 述。别的，看待基因组“黑名单”区域，因为这些区域正在△基 ○于二代短读段测序平台 的外观遗 传妆点 测○序数据中平=时显示出十分 高的信号，而且与实习 样本类型 和统治条目等无合，因而正在数据阐述时，咨询职员平时△直接将其 驱除以裁减■引入的明显噪音。这导致这些区域的外观遗传妆◁■点形态目前已经是未知的。因而，基于二代测序平台来解析基因组=庞大区域的染色质妆○点形态还是是一项…巨大离间。尊龙凯时人生就博

　　基于二代测序平台检测手段的另一个紧要局部正在于无法正在单细胞程度上直接检测统一条DNA分子上相邻调 控元件（比方相邻的启动子和巩固子）是否存正在相像组卵白妆点或相像转录因子的共占位事 务。别的，短读段△=也束缚了其对染色质妆点举…行单倍型阐述的本 ○事，而单倍型=阐述看待探究二倍体细胞中等位基因上调控元件间的彼此效率及深远剖释等位基因异质性至合紧急。近年来，几种基=于长读段的 外观基因 组测序手艺被…开荒 ■出来，征求Nanopore-DamI D和DiMelo-seq，它们有助于解析基因组庞大区域的卵白质-DNA彼此效率无创产前DNA检测。然而，这些手艺无法实行单○细 胞辨◁别率，还是局部于巨额肇□端细胞的样…本，难以操 纵于咨询细 胞群▽体内部的○异质性。

　　为了应对这些离间，2024年10月7。